Efraim Blotner wurde 1921 als Walter Blotner in eine jüdische Wiener Familie geboren und wuchs mit seiner fünf Jahre älteren Schwester im 8. Bezirk bei seinen Eltern auf. Bis 1934 war er Mitglied der Kinderfreunde, seine Schwester war Mitglied der Sozialistischen Arbeiterjugend. Efraim Blotner verließ die Schule im Alter von 15 Jahren, konnte jedoch keine Arbeit finden und begann, seine Emigration zu planen. Im Herbst 1938 erhielt er eine Bescheinigung zur Einreise nach Palästina, wo er im Februar 1939 mit dem Schiff Galilea ankam. Er absolvierte eine Ausbildung zum Tischler und lebte in verschiedenen Kibbuzim. Als die britische Besatzungsmacht 1946 im Kibbuz Jagur einen der größten illegalen Waffenvorräte des Landes entdeckte, wurde Efraim Blotner von der britischen Armee in ein Lager nahe der ägyptischen Grenze geschickt und drei Monate lang gefangen gehalten.